Con el fin de asesorar a Uxue Barkos así como de analizar y buscar soluciones para los diferentes problemas de los navarros se han creado diferentes Comisiones de Apoyo encauzadas a mejorar la labor que Nafarroa Bai desarrolla a la hora de llevar la problemática de Navarra al Congreso. Hasta ahora se han constituido las siguientes comisiones:

 
 
Comisión de Infraestructuras
(responsable: Txentxo Jiménez)

  
 
Comisión de Derechos Humanos, Libertades Ciudadanas e Internacional
 
Comisión de Municipios y Entes Locales
(responsable: Maiorga Ramirez)
 
Comisión de Euskara y Educación (responsable: José Luis Mendoza)
 
Comisión de economía
(responsable: Koldo Amezketa)

 
Comisión de asuntos sociales
(responsable: Jesús Urra)

 
Comisión de Política General
(responsable: José Antonio Urbiola)